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為什么要進(jìn)行進(jìn)行細(xì)胞系STR鑒定

 更新時間:2023-04-03 點擊量:671

據(jù)統(tǒng)計約30%細(xì)胞系被交叉污染或錯誤辨識,只因使用了交叉污染或錯誤辨識的細(xì)胞而導(dǎo)致研究結(jié)論錯誤、結(jié)果不可重復(fù)、臨床細(xì)胞治療災(zāi)難性后果……,這將浪費大量時間、精力和金錢。


世人皆知,細(xì)胞身嬌體貴難養(yǎng)活,養(yǎng)好細(xì)胞實屬不易。而這其中煩的是污染、怕的是掉包。因為盡管研究僧們有方法把一切污染的源頭扼殺在搖籃之內(nèi),卻沒有火眼金睛辨別已經(jīng)換了馬甲的錯誤細(xì)胞。因而細(xì)胞一旦被李代桃僵,再資深的科研者都會陰溝里翻船,所以細(xì)胞鑒定顯得尤為重要。

為什么要進(jìn)行細(xì)胞系鑒定?

進(jìn)行細(xì)胞系STR鑒定是很重要的。很多生物醫(yī)藥的研究都采用培養(yǎng)細(xì)胞來進(jìn)行,這些細(xì)胞可能是受贈于其它研究人員,也可能是從細(xì)胞庫(如美國?ATCC,American?Type?Culture?Collection)得來。據(jù)估計,15-20%的實驗室,實驗中所使用的細(xì)胞已經(jīng)不是原來的細(xì)胞系,或者與其它細(xì)胞系發(fā)生了交叉污染。顯然,細(xì)胞系遭到污染、特征鑒別錯誤,將會極大的威脅著基于這些細(xì)胞而發(fā)表的論文質(zhì)量和研究發(fā)現(xiàn)的正確性。





如何根據(jù)STR數(shù)據(jù)判斷細(xì)胞系身份?

收到細(xì)胞系鑒定結(jié)果以及 STR 信息,可以與參考數(shù)據(jù)庫進(jìn)行比對。如果細(xì)胞樣本的每個 STR 位點和參考細(xì)胞 STR 位點都能重合匹配,即說明該細(xì)胞系正確,反之則說明你的細(xì)胞系可能被錯誤標(biāo)記,交叉污染或發(fā)生遺傳不穩(wěn)定。一般說來,匹配度≥80%即可認(rèn)為該細(xì)胞系正確,匹配度<80%則說明該細(xì)胞系的來源需要被懷疑。


如果細(xì)胞系被鑒定出發(fā)生交叉污染或錯誤標(biāo)記,則需要拿更早代數(shù)的細(xì)胞進(jìn)行鑒定,從而找到問題的起源或者直接從可靠的機(jī)構(gòu)購買一株新的細(xì)胞系。


生物細(xì)胞STR鑒定服務(wù)


STR(Short Tandem Repeat,短串聯(lián)重復(fù)序列)基因分型已被ICLAC、ATCC等機(jī)構(gòu)作為鑒別細(xì)胞身份及交叉污染的金標(biāo)準(zhǔn)。海星生物對人源細(xì)胞21個STR位點進(jìn)行檢測,可方便與數(shù)據(jù)庫進(jìn)行比對,具有較高的準(zhǔn)確性。


STR基因位點由長度為3~7個堿基對的短串連重復(fù)序列組成, 這些重復(fù)序列廣泛存在于人類基因組中,可作為高度多態(tài)性標(biāo)記,被稱為細(xì)胞的DNA指紋。STR 基因座位上的等位基因可通過擴(kuò)增區(qū)域內(nèi)重復(fù)序列的拷貝數(shù)的不同來區(qū)分,在毛細(xì)管電泳分離之后可通過熒光檢測來識別。隨后通過一定的計算方法,即可根據(jù)所得的STR分型結(jié)果與細(xì)胞STR數(shù)據(jù)庫比對從而推算出樣品所屬的細(xì)胞系或可能的交叉污染的細(xì)胞系名稱。


|  海星生物細(xì)胞系鑒定位點

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| 細(xì)胞系鑒定服務(wù)流程

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